《吉林大學學報(醫(yī)學版)》為中文核心期刊和中國科技核心期刊，主要報道醫(yī)學科學研究的新理論、新方法和新技術(shù)，設有基礎(chǔ)研究、臨床研究、臨床醫(yī)學、影像學、調(diào)查研究、技術(shù)交流及綜述等欄目，被荷蘭《醫(yī)學文摘》和《 CA 》等 20 余種國內(nèi)外數(shù)據(jù)庫收錄。
根據(jù)中國科學技術(shù)信息研究所2009年版《中國科技期刊引證報告(核心版)》收錄的1868種中國科技論文統(tǒng)計源期刊的統(tǒng)計報告，2008年《吉林大學學報(醫(yī)學版)》總被引頻次為934、影響因子0.400、被引半衰期4.58(即年指標0.018)、他引率0.88、引用刊數(shù)33、擴散因子3.53、權(quán)威因子333.69、學科擴散指標0.67、學科影響指標0.57、文獻選出率0.64、參考文獻量2776、平均引文數(shù)9.91，在49種醫(yī)科大學學報類期刊中總被引頻次排第7名，影響因子排第9名。 [8]
據(jù)2019年2月22日中國知網(wǎng)顯示，《吉林大學學報(醫(yī)學版)》總被下載1125003次、總被引46662次、(2018版)復合影響因子為0.978、(2018版)綜合影響因子為0.775。 [2]
