橫向科研項目的風險性是由于橫向科研項目的獨特性、制約性等特性所造成的。因為一個橫向科研項目的獨特性就意味橫向科研項目是市場新技術、新工藝或者技術更新等地方是以前尚未碰到過的事情，所以就會有沒有認識清楚的規律，就會有各種各樣的變化，橫向科研項目中就包括了很多的不確定性因數，從而使得橫向科研項目具有風險性的特點。由于橫向科研項目的風險性使得科研項目管理與日常運營管理有很大的區別。同時這也造成了在橫向科研科研項目管理中，風險管理變得十分重要，并且成了項目和項目管理的成敗關鍵。
在橫向科研項目的管理中引進風險管理的技術，就是要對所制定要實現的目標進行主動控制，預防在橫向科研項目開展當中所遇到風險和干預因素，保證所定目標的實現。雖然對橫向科研項目進行風險管理需要一定的時間和精力，需要進行風險的計劃編制、風險識別、風險分析、風險監控以及風險的處置等工作，都要占用有限的資源和人力，但是非常必要。
任何事物都有各自的屬性，這些屬性是由各種數據和信息加以描述的，橫向科研項目也一樣。科研工作人員通過現在掌握的科學及時水平和對橫向科研項目的要求信息，預見未來要達到的結果。但是由于人們認識事物及其特性的能力有限，所以在認識深度與廣度兩方面具有一定的局限性，人們對世界上許多事物屬性的認識仍然存在一定的差異性，在處理事情的方法上有各自的習慣和經驗。橫向科研項目也不例外。對于橫向科研項目認識上的這種局限性，從根本上說是人們獲取數據和信息的能力有限性和客觀事物發展變化的無限性這一對矛盾造成的，這使得人們無法獲得項目的完備信息，從而不能準確的預見項目的未來發展變化，造成項目的風險。
造成項目風險的原因除了人們自身的主觀認識能力和信息的滯后性等原因外，另外一個原因就是項目和項目所面臨的內外部環境發展變化所造成的不確定性。因為橫向科研項目的開發周期一般都比較長，影響內外部條件的因素都有可能發生變化，比如市場需求信息的變化，在研發當中所需技術的變化以及一些不確定因素的發生。橫向科研項目的資金到位情況、科研中作者的可延長新能力、采購等各方面的因素都有可能對項目的最后結果產生影響。而在項目的外部，項目投資人的利益、項目的時間計劃、科研環境的變化以及社會對項目結果的認可程度等都會對項目產生重大的影響。這些項目的環境和條件發生變化以后，這些因素都影響了橫向科研項目的原有計劃，需要進行調整以適應新的環境的發展與變化，其內外環境的各種發展與變化所帶來的項目的不確定性，這些因素都影響了橫向科研項目計劃和進程，而這種項目的不確定性也是項目出風險的一個重要因。
信息的滯后是造成風險的因素之一從信息科學的角度看，造成事物信息不完備的客觀原因是信息本身的滯后性。理論上所有事物的屬性都可以由數據加以描述的，但是這些數據只有在事物發生以后才能獲得，然后再由人們處理后才能產生對于決策有支持作用。因此一個事物的信息總是在事物發生之后生成數據并經過再以后才能產生的，所以任何事件的信息總會比它本身有一個滯后，也就形成了所謂的信息本身的滯后性。橫向科研項目是理論知識在實踐中的應用，該事件在以前是沒有的，它的本身是一種新生事物，他是新技術在中的應用。它本身的實際數據尚未發生，所以在決策中所使用的信息都是根據過去所發生的事件做出的推斷，推斷的依據只是理論的依據，這就導致了信息的不完備，造成了很多的風險隱患。只有隨著橫向科研項目開發過程中，科研工作者對它的認識不斷深入，取得完整的數據，信息的完備性程度也會不斷提高，直到項目完成時人們才能獲得完備的項目信息。這種信息的滯后性也是項目風險的根本原因。
橫向科研項目屬于科技創新，科研工作者希望能成功的進行科研創新，取得科研成果并發表學術論文，取得事業的成就并得到一定的經濟利益。但是橫向科研項目創新系統存在著很多的不確定
因素，在這些不確定因素的作用下，其創新活動最終可能出現三種結果：一是創新活動成功，達到了預期的目標或者接近預期目標；二是創新活動失敗，未能實現預期目標，并且損失了大量的時間、人力物力，創新活動的大量投資也無法收回；三是科研創新沒有達到理想的效果，僅使投入與收益基本持平。還有橫向科研項目在合同簽訂時沒有明確該成果的責權的約定，做成日后成該成果的產權糾紛，陷入長時間的口水戰，甚至動用法律途徑解決產權糾紛，做成不必要的人力物力浪費。科研開發周期的估算是否準確，有的在競標當中，為了擊敗競爭對手，取得橫向科研項目采用壓低預算成本，或者因為考慮不周，把有些內容沒有考慮到，遺漏了這部風內容等情況，造成所需費用的預算偏低，影響了橫向科研項目的進度。
風險識別是橫向科研項目管理者識別風險來源、確定風險發生條件、描述風險特征、評價風險影響的過程。風險識別需要確定三個相互關聯的因素：風險來源、風險事件、風險征兆。
橫向科研項目的風險來源一般來自技術風險，對所需的技術或者現有的技術對在研發過程中需要解決的實際情況之間的差距，他們設計的是新技術、新領域、新工藝的要求，這個要求在以前還沒有出現，解決這些問題是建立在科學的推理或推斷的情況下做出的科學化的理論推斷。而解決這些問題是在現有的科學技術或者理論基礎下對新生事物的研究開發，現有技術的支持力度也決定了風險的存在和發生；質量風險：技術需求方與開發方隊新產品、新工藝質量的約定，技術開發放在實現產品或工藝時，影響質量體系的因素很多，其質量最終檢驗達到雙方約定，則為成功的案例，負責將會浪費很大的人力、物力，做成很大的風險；過程風險是指在技術開發過程中所存在的各種不確定因素，這包括在整個產品開發過程中的各種因素的作用；管理風險是指在技術開發當中參與管理方法、管理形式、對資源的管理能力、人力資源的合理利用、內部成員的溝通能力、成員之間的技術協作、團隊成員學術互補性、計費的到位情況等方面的內容；其次還有組織機構風險以及市場需求變化引起需求方對產品技術要求的變更等方面的風險。 風險識別后要把結果整理出來，為風險分析的其余步驟和風險管理做好準備。
橫向科研項目的風險估計是對風險存在及發生的可能性以及風險損失的范圍和程度進行衡量和估計。橫向科研項目是新技術、新工藝等的創新，屬于新生事物，對于他來講，可以借鑒的經驗比較少，在技術和工藝等方面，研究人員對它的認識主要是通過技術分析和相關人員收集的一些數據，這些都對該項目的研發還是停留在理論知識的人事方面，存在一定的風險。這有認識到風險的存在，就要對它存在風險作出理性的分析和估計。風險事件分為確定型事件和不確定型事件。確定性事件發生的概率判斷是根據歷史資料確定風險事件概率的分布，根據以前相似的實驗數據和收集的資料數據分析風險發生的概率或者利用理論概率分布情況作出判斷。要估計風險發生概率的大小，并且要估計出可能對橫向科研項目造成損失的嚴重程度作出估計。通過風險發生的概率和可能做成的損失程度，根據以上分析的結果，預測風險發生的次數以及其發生的后果，作為決策的依據。
橫向科研項目的風險管理規劃是指規劃和設計如何進行橫向科研項目風險管理的過程中，該過程包括定義該橫向科研項目的組織，團隊成員風險管理的行動方案，管理和溝通方式，選擇適當的風險管理方法，確定風險判斷的依據等內容。風險管理規劃是橫向科研項目風險管理的第一步，橫向科研項目是一項科學研究，是一項細致而嚴謹的科學研究過程，需要制定詳細規劃和風險預判，從而制定一份詳細分線管理規劃，預防風險的發生，或者將風險降低到最低的水平。任何橫向科研項目都是一個系統的綜合性工程，牽扯到各方面的問題，在明確了該項目的目標后，需要用到的設備，科研團隊成員的職責、對風險的認識和預防能力、分項目的完成情況及對其他成員進度的影響、利益相關方的溝通局渠道和方式以及其他因素的影響等非常多的方面，它需要我們處理好整個項目過程中各個細節，具有很高的集成性。因為在整個開發研制的進程中，一個很小的失誤都可能對整個橫向科
研項目帶來巨大的風險，因此橫向科研項目的風險管理規劃是我們必須關注的問題。具體的科研項目風險指南應包括以下主要內容：該項目的風險管理方法、項目風險管理的目標，工具和技術以及相關的管理規定，該橫向科研項目風險管理的需要承擔的責任，描述整個橫向科研項目生命周期內科研團隊成員如何組織和執行風險識別，項目風險的預判和可用資源的合理安排，項目風險管理的時間和進程安排，項目風險度量方法的規定，項目風險管理和應對措施的報告規定，項目利益相關者對項目風險的敏感程度和對風險的承受能力，以及項目風險跟蹤的辦法和要求等方面的規定。
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